洪武元年(1368年)
　　正月，明军征南将军汤和分兵征兴化、泉州、漳州。漳州拒降。二月，明军攻破漳州，元达鲁花赤德尔密实(或作“迭里迷实”)自杀，总制陈马儿降明。汤和命指挥李执中守漳州。
　　同年，漳州路改为漳州府，属福建行省平章政事管辖。至洪武九年(1376年)，改浙江、江西、福建……等行省为承宣布政使司，罢行省平章政事左右丞官职。漳州时属福建承宣布政使司。
　　洪武三年(1370年)
　　五月，置漳州卫，驻于龙溪县城，辖中、左、右、前、后5个千户所，兵额5600，属福建都指挥使司(《明太祖实录》作洪武元年六月，1368年，立漳州卫)。
　　洪武四年(1371年)
　　张士诚、方国珍残部窜匿海岛，勾结倭寇骚扰海疆。诏令禁止海民私自出海，漳州对外贸易顿受抑制。后因倭寇、海盗为患愈烈，海禁愈严。成化年间，龙溪人屡有犯禁被处死者。
　　洪武十四年(1381年)
　　南靖县民举事，南雄侯赵庸遣兵压服。
　　同年，龙岩县发生民变，自立官属，侵掠龙溪县。建宁、泉州、漳州三卫指挥联合率兵弹压。翌年龙岩民变再起，福建都指挥使司发兵讨平。
　　洪武二十年(1387年)
　　江夏侯周德兴巡视闽粤，置镇海卫，址在漳浦县二十三都(今龙海市隆教畲族乡镇海村)，辖前、后、左、右、中5个千户所及六鳌、铜山、悬钟3个千户所。
　　洪武二十一年(1388年)
　　在柳营江、檺门、岛美、青山、井尾、古雷、后葛、赤山、洪淡、金石等地设巡检司，盘查往来行旅、缉捕贩运私盐者和逃犯。
　　洪武二十九年(1396年)
　　明廷应琉球中山国国王尚氏之请，迁福建沿海36姓船民至琉球，传授造船、航海技术。龙溪县有阮、毛、陈、王诸氏船民留居琉球，后裔今住日本那霸市久米村(1988年阮氏后裔曾组团回漳寻根谒祖)。
　　永乐八年(1410年)
　　南靖县(明正德析为平和县)人李瑾、林应辰募众修筑湖潭陂，灌田千亩。　
　　宣德四年(1429年)
　　三月，倭寇自漳浦县古雷头登岸，围攻县城。后，倭寇攻铜山水寨，劫西土楼及月港，犯云霄镇，在漳州造成重大罪行27起，烧屋千余家，杀戮军民不计其数。至嘉靖四十二年(1563年)四月，福建总兵官俞大猷、副总兵官戚继光合力攻倭于平海，戚率中军斩敌2200余人，倭患渐息。
　　宣德五年(1430年)
　　三月，长泰县林震登进士第，殿试第一名，为漳州添一状元。
　　正统三年(1438年)
　　龙溪县民罗三福等聚众举事，福建都指挥佥事陶旺率兵进剿，罗三福等576人不幸被俘。
　　正统十年(1445年)
　　十一月十四日(12月12日)，漳州地震，日夜震9次，波及龙岩、长泰、南靖等县，山崩石坠，地裂泉涌，房屋倒塌，百余日始止(震中漳州，北纬24°30′、东经117°36′，里氏6.2级、烈度8度)。
　　正统十一年(1446年)
　　广东饶平千余人流劫入漳，四月焚月港。士绅陈孔叶率众抗击，歼其魁首，平饶乱。
　　正统十三年(1448年)
　　八月，沙县人邓茂七于宁化起义，聚众数万，自称铲平王，攻陷沙县、龙溪、汀州、长泰、龙岩、南靖等20余县。翌年，邓茂七攻延平时阵亡。
　　正统十四年(1449年)
　　邓茂七余部杨福率众数万人南下，漳民张福荣、曾钦重、陈皓、蔡孟员等响应，遂攻陷漳浦，围漳州，分兵攻南诏，历时8个月。
　　同年，泉州、永宁二卫调回在漳屯兵，地由漳民耕种(永乐间泉州、永宁二卫在漳州府龙溪县、漳浦县、长泰县、南靖县屯田，泉州卫屯田63顷24亩，永宁卫有田39顷31亩)。
　　景泰三年(1452年)
　　漳州境内设铜山、浯屿两个水寨防倭，时两寨为福建五大水寨之一。铜山水寨有船46艘、官兵1141名；浯屿水寨在大担，有船48艘、官兵2200名。
　　同年，龙溪(今龙海市海澄镇)人刘廷奋率众修太保陂，灌田百余顷。
　　天顺元年(1457年；另称成化二年即1466年)
　　陈亹任广东布政使，引进岭南荔枝良种，移植于家乡鉴湖(今漳浦佛昙大坑)。
　　天顺五年(1461年)
　　五月十九日夜(6月26日)，大风雨，坠石拔木，洪水泛滥，漂没人畜，龙溪县城东门谯楼倒塌。漳浦县漂人畜尤甚。
　　天顺七年(1463年)
　　疾风暴雨，北溪水涨，柳营江桥亭漂没。
　　成化七年(1471年)
　　析龙岩九龙乡居仁等5里立漳平县。
　　同年，龙溪人丘弘敏与族人渡海至满剌加等国贸易，后至暹罗国(今泰国)谒见国王，其妻冯氏受王后召见。后，丘氏返至漳州，被以“冒充使节”治罪，弘敏等29人被斩首。
　　成化八年(1472年)
　　四月，龙溪县民29人出洋，被官军追捕，下狱伏诛者14人，余多瘐死。
　　成化十年(1474年)
　　四月，有大鸟止郡庭榕树上，身色青灰，翅黑，嘴足淡红，头举高丈余，舒其翼长两丈。
　　七月初五夜(8月17日)暴雨，山崩，洪水骤至(洪峰流量为85000立方米/秒至10000立方米／秒之间)，城垣被淹，浮尸蔽江，庐舍大部分损坏倒塌。
　　成化十一年(1475年)
　　八月，漳州大疫，死者无数。
　　成化十七年(1481年)
　　九月，黄昏，西方有大星坠地，其声如雷，园蔗烧死。
　　成化十八年(1482年)
　　知府姜谅率领民众在龙溪、海澄修筑港闸陂塘等水利工程41处，灌田2000多顷。
　　八月十九日(9月1日)夜，漳城大火，烧毁双门楼及官署民舍数百间。
　　弘治十二年(1499年)
　　南靖县民开凿坑头陇大溪圳，灌田200余顷。嘉靖十三年(1534年)，圳砌石墙，民间受益至今。
　　正德二年(1507年)
　　平和县人詹师傅(名佚，因以竹业为生，故称师傅)与温火烧，以芦溪、象湖为根据地，聚众起义。
　　正德七年(1512年)
　　铜陵(今东山县铜陵镇)关帝庙落成。洪武二十年(1387年)建置铜山城时，在天尊堂右祠堂内祀关帝神像，祈护守城官兵。正德三年(1508年)，云霄人吴子约避难铜陵，与善士黄宗继等人发起募建庙宇。是年五月初七日(6月5日)破土动工，至正德七年(1512年)完工，历3年7个月，庙深120尺、宽51尺。
　　正德八年(1513年)
　　詹师傅义军与江西横水、桶岗谢志珊、蓝天凤，广东浰头池仲容、池大宾协同，转战闽、粤、赣边区，明廷称此次起事使“三省骚然”。
　　同年，知府陈洪谟聘周瑛任总纂，修成《清漳志》。
　　正德十一年(1516年)
　　漳州发生大饥荒，潮州闭粜甚严。时潮州通判陈令系龙溪县人，力请开禁，漳州方得接济。
　　正德十二年(1517年)
　　正月初三，都察院佥都御史王守仁命闽、粤、赣三省官军向詹师傅义军发起进攻。官兵战败。
　　三月二十五日，王守仁亲临指挥，兵分5路，詹师傅义军据点相继失守，首领先后牺牲，起义终告失败。
　　五月，王守仁为防范农民再次举事，加强统治，议析南靖县之清宁、新安二里共12图建平和县。翌年再奏，县治设在河头大洋陂。正德十四年(1519年)，明廷始命罗干任知县。
　　八月，南澳地震，漳浦渐山(今诏安)劈裂，深、广丈余。
　　九月，因“朱”与“猪”同音，避讳，奉旨禁养猪，违者终身充军。漳州府定10天之内将猪仔活埋，大猪尽杀，猪肉贱价出售。
　　嘉靖五年(1526年)
　　在龙溪县11都建置石码镇，市街以千字文命名，并划分为上、下码。
　　嘉靖八年(1529年)
　　正月十五日(2月23日)，长泰县城谯楼前举办花灯会，因观众拥挤，自相践踏，踩死107人。
　　同年，为适应对外贸易，加强海道管理，设巡海道，于漳州开署。
　　嘉靖九年(1530年)
　　正月，漳浦县四都海面出现沧屿三峰并列，某日忽没于海，顷之三峰并为一，屹立云空，有楼台之状，变态无常，浮沉不一，如是凡三日。
　　同年，漳浦县南诏千户所升为诏安县，分1坊4都23图。
　　同年，漳浦饥荒，其春麦熟，山竹生实如米，采之数百石，饥民赖以供食。
　　嘉靖十五年(1536年)
　　南靖大旱，并发蝗灾。
　　嘉靖十六年(1537年)
　　大旱，漳浦自五月至次年四月不雨，漳州及沿海各县受灾尤为严重。
　　嘉靖二十四年(1545年)
　　正月十六日(1月28日)夜，南山寺火灾，寺院烧毁。
　　是年旱，龙溪、漳浦、长泰、龙岩、南靖5县大饥荒。长泰、龙岩4月下冰雹，8月发大水。
　　嘉靖二十八年(1549年)
　　五月初五(5月31日)，漳州城南门溪举办龙舟竞赛，午后突遭台风袭击，船覆，溺死60多人。
　　十月十二日，地大震，漳浦、长泰“有声如雷”(震中南靖，北纬24°30′、东经117°24′，里氏5级)。
　　嘉靖二十九年(1550年)
　　嘉靖《漳郡志》修成。
　　嘉靖三十年(1551年)
　　在月港设立靖海馆。
　　嘉靖三十三年(1554年)
　　漳州城下黑雨。
　　嘉靖三十四年(1555年)
　　漳州城东门外璞山岩寺僧秘制的八宝丹(即今片仔癀)问世。
　　嘉靖三十七年(1558年)
　　十月二十四日，诏安红水随潮上，濒海居民取蚝食者多死。
　　嘉靖三十八年(1559年)
　　三月，倭寇由东厝岭进犯月港八、九都，转石码、福浒、东洲、水头，夺舟流劫；八月，再由龙溪天宝入南靖，所过焚掠一空。
　　嘉靖三十九年(1560年)
　　饶平张琏部2000余人陷云霄、诏安二都。次年，陷镇海、南靖。
　　嘉靖四十年(1561年)
　　月港民张维、洪迪珍等反明，号称“二十四猛(将)”。
　　嘉靖四十三年(1564年)
　　二月，抗倭名将戚继光追击倭寇至漳浦，围倭寇于蔡陂，杀敌千余，闽境大规模的倭患从此基本结束。
　　嘉靖四十四年(1565年)
　　五月，诏安大盗吴平私造船数百艘，聚众万余人，于近岛筑3城自守，活动于潮州、惠州、诏安、漳浦一带沿海。
　　嘉靖四十五年(1566年)
　　二月，俞大猷率水兵，戚继光率陆军围剿大盗吴平，吴逃入饶平县凤凰山，后又逃往海上。四月，在明军夹击下，吴平投海自杀。
　　十二月(1567年1月)，析龙溪县1至9都、28都5图及漳浦县23都9图地建置海澄县。县治设于月港(今龙海市海澄镇)。
　　同年，改龙岩集贤里之东、西洋巡检司为宁洋县。
　　隆庆元年(1567年)
　　福建巡抚都御史涂泽民奏准开放部分海禁，海澄县月港获“准贩东西洋”。月港从景泰四年(1453年)兴起，至此开始步入鼎盛时期，成为我国东南沿海对外贸易的一个重要港口。时每年风汛期，启航商船至少有137艘。大船载重200吨至500吨，小船100余吨，主要航行于东南亚诸国和日本诸岛。输出货物有：丝绸、布匹、陶瓷、茶叶、砂糖、纸张、果品等；输入有香料、珍宝、皮革、洋布以及农产品、手工业品原料。设立海澄县至万历年间1573年至1615年为全盛时期，年征税收由起初3000两白银至全盛时期上升至3.5万两。初期于月港设立“督饷馆”，以海防同知督理验关、征税、发照；万历二十七年(1599年)闰四月，明廷派税监高寀督理税务。时月港被誉为“天子之南库”。天启二年(1622年)开始衰落。月港兴盛达170年。
　　隆庆二年(1568年)
　　曾一本流劫潮州、诏安县。九月，再劫掠饶平、诏安县境。翌年五月，曾屯于云盖寺、拓林等澳，官军会剿，俘曾一本，杀伤700余人。
　　隆庆四年(1570年)
　　六月初六，龙溪、漳浦、长泰、南靖、平和，烈风暴雨(洪峰流量达8500立方米秒至10000立方米／秒之间)，洪水漂没民居不可胜数。郡南桥被损坏。
　　万历元年(1573年)
　　六月二十四日夜(7月22日)，月港大火，烧毁桥板和店屋百余间。
　　同年，由知府罗青霄主持，郡人谢彬任总纂，龙溪县儒官王豸类稿，《漳州府志》修成。因是年为癸酉，俗称该志为“癸酉志”。
　　万历三年(1575年)
　　九月，烟叶由菲律宾海路传入月港，在漳州府沿海一带开始种植，并逐渐向各地推广。
　　万历五年(1577年)
　　西班牙奥斯定会教士从马六甲来漳州传教，因不得驻留而折回。
　　万历九年(1581年)
　　五月二十四日(6月24日)，江鳄出没于龙溪县11都芦洲渡至虎渡江域，损伤农作物。百姓认为“龙”起，未加伤害。
　　万历二十年(1592年)
　　二月二十九日(4月11日)，长泰白莲教举事，教头董公率教徒攻县城，砍伤县令李学诗，打开牢房，救出蔡扬中等人。因提前举事，准备响应的海防卫所士兵未能增援，举事终告失败。
　　万历二十一年(1593年)
　　九月二十二日(10月16日)，菲律宾殖民总督达斯玛利那率领舰队远征荷属摩鹿加群岛，拘捕涧内华人70人至80人充作舰上劳力，华人被迫杀死总督及舰上大部分官兵，舰艇驶回中国，途经安南北部海域时，被安南当局扣留。消息传至菲律宾，西班牙殖民当局尽逐珉里拉华人于城外。达斯玛利那之子路易斯继任总督后，又驱逐5000余华人出境，许多漳州籍华侨因此破产回国。
　　万历二十七年(1599年)
　　闰四月，税监高寀抵月港办税，因其横征暴敛，月港人民掀起驱逐高寀斗争。至万历三十年(1602年)，“寀为宵遁”，自此不敢复至海澄。
　　万历二十八年(1600年)
　　八月二十三日(9月29日)，漳浦发生地震。一夜连震5次。水磨径口有巨石崩坠。诏安地震尤甚。
　　同年，宋代皇族后裔赵范开始在漳浦湖西修建赵家堡。20年后，其子赵义扩建完成。赵家堡今为旅游胜地。
　　万历二十九年(1601年)
　　龙溪县翰苑社(今步文镇后坂村)严世同，早年在广东为官时接受意大利传教士利玛窦洗礼入教，为漳籍第一个天主教信徒(严氏撰述《天帝考》一书，被收存于梵蒂冈教廷)。返乡后，他劝导亲属和族人信教，遂使翰苑社成为天主教村。
　　十月十一夜戍时地大震；子时又震；至五更，有星变如雨(震中漳州与南靖交界处，北纬24°30′、东经117°30′，里氏5.2级)。
　　万历三十一年(1603年)
　　同安人张嶷妄报机易山有金矿，明廷派海澄县丞王时和与百户于一成抵菲律宾勘探。菲律宾殖民当局借机煽动土著和旅菲日本人抢夺华侨财产，残杀无辜华侨近2.5万人。海澄人占十之八。
　　八月初五(9月9日)未时，飓风大作，漳浦、长泰、龙溪、海澄4县城垣、公廨、民舍多被摧毁。海潮溢过堤岸丈余，浸没数千家，人畜淹死不可胜数，并有大番船漂入石美镇城，压坏民舍。
　　八月初六(9月10日)，漳浦县发生洪水、飓风暴作。滨海有数千人溺死。
　　万历三十二年(1604年)
　　十一月初九(12月29日)戍时，漳浦大地震，伴有响声，民房多数倾倒。后又连日微震。县城南门外大陂田中陷成一穴，阔5丈余，深约2丈，有黑沙混水涌出。
　　万历四十年(1612年)
　　正月初二日(2月3日)，月港成衣匠颜思齐因遭官家欺凌，逃往日本。天启元年(1621年)，他与郑芝龙、陈勋、陈衷纪等28位结盟兄弟参与日本农民、町人(居民)的政治斗争，因幕府缉捕，于八月十四日结伙逃离日本。八月二十三日(9月17日)在台湾笨港登陆。颜思齐以诸罗山为根据地，开拓疆土，分设10寨，被众拥立为“开台王”。天启五年(1625年)十月，思齐患恶性霍乱症死，年仅37岁。
　　万历四十一年(1613年)
　　由知府闵梦得主修，刘庭蕙任总纂，林茂桂、张燮等编修，《漳州府志》完稿，是年为癸丑，俗称“癸丑志”。该志于万历四十七年(1619年)袁业泗继任知州事后刊行。
　　万历四十五年(1617年)
　　由龙溪人张燮撰写的《东西洋考》刊行，人称此书为“海上方志”。
　　天启三年(1623年)
　　荷兰殖民主义者骚扰金门、厦门、海澄，继而进犯漳浦六鳌。漳浦把总刘英出击，敌舰逃泊浯屿，盘踞于圭屿。
　　天启六年(1626年)
　　九月，东林后七君子之一、右佥都御史、苏松十府巡抚海澄人周起元被魏阉陷害，死于狱中。崇祯元年(1628年)冤雪，追赠为兵部侍郎，谥忠愍。
　　崇祯元年(1628年)
　　四月初二(5月5日)，著名旅行家、地理学家徐霞客由漳平乘船沿九龙江至罗溪；崇祯三年(1630年)八月二十六日(9月23日)，第二次从宁洋顺九龙江抵漳州。崇祯六年(1633年)秋，第三次来漳州，与黄道周同游大峰山。徐霞客将三次实地考察漳州名山和九龙江水系详细情况记录下来，后人为其整理辑入《徐霞客游记·闽游日记》中。
　　同年，漳州僧人觉海东渡日本，于长崎建福济寺(又名漳州寺)。
　　崇祯五年(1632年)
　　海盗刘香老犯海澄、浮宫，次年劫诏安。
　　崇祯十二年(1639年)
　　菲律宾内湖省加南巴华侨6000人被殖民当局强迫充当垦荒劳役，死者300余人，其中有部分漳州人。同年十月二十五日，华工举事，杀死管理官员和两名天主教神甫，并进军珉里拉。二十七日(21日)，至达内湖省山伯罗与西菲联军激战数日，因无后援，退回加南巴。西班牙军在大山伯罗、仙沓克罗斯和涧内等地杀害华侨达2.2万余人，同时又把涧内8000余华侨迁往巴石河北岸的眉眉村(今仙罗危拉区)。
　　崇祯十三年(1640年)
　　伭云七才子之一张燮逝世。张著有《东西洋考》、《闽中记》等，闻名于世。
　　八月，漳浦西宸岭雨白豆，鸡犬食之立毙。
　　崇祯十四年(1641年)
　　冬，诏安有芒星数十拥一大星，自坠于西，有声如雷。