漳州市陆域地处北纬23°34′至25°15′，东经116°54′至118°08′之间，南北长187公里，东西宽127公里，面积12607平方公里。海域面积略大于陆域。
　　境域内多山，地形总的是西北高，东南低，博平岭山脉横亘于西北部边界，戴云山余脉深入北部境内。平和县大溪、安厚、国强、霞寨，南靖县南坑、船场一线以西，南靖书洋，平和芦溪、长乐、九峰一线以东地区，为全市地势最高处，也是九龙江西溪、漳江、东溪、芦溪、九峰溪等河流的发源地。沿海地区的乌山山脉与梁山山脉直逼海岸，高山与碧海辉映，景观壮丽。
　　南部的龙海、漳浦、云霄与诏安4县濒海，东山原为一岛县，20世纪60年代初建成八尺门海堤后，已有陆路与大陆相通，成为人工半岛。海岸线曲折，多港湾，从九龙江口至诏安与广东饶平的海岸分界点，海岸线总的走向呈北东向，正面宽约128公里，海岸线长631公里，有12个较大海湾与河口湾。海岸类型齐全，有岩岸、泥岸、沙岸和河口平原海岸，以及人工海岸。辖区内有502个岛屿礁石。
　　市内陆域地质受印支—燕山—喜马拉雅山等期造山运动影响，构造十分复杂，总的地质构造受北东向华夏式、北北东向新华夏式与北北西向太义山式控制。北部地区沉积岩以褶皱为主，断裂次之，中南部岩浆岩以断裂为主，褶皱次之，力学性质以压扭性为主。山地组成物质以中生代火山岩与燕山期花岗岩为主，岩性坚硬，抗蚀力强，大多沿节理风化崩裂，形成陡峭山峰。
　　海域地质以滨海断裂带为界，断裂带呈北东向，从兄弟屿通过，大致平行于海岸线，两侧地质迥异，北侧地质是大陆延伸部分，南侧属南海亚板块。
　　漳州气候属南亚热带海洋季风气候，北有高山阻挡寒流侵袭，南有海洋调节，所处纬度较低，靠近北回归线，气候温暖，雨量充沛，冬无严寒，夏无酷暑。然降雨的年际与季节变化大，旱涝灾害交替出现，地理分布也不均匀，雨量山区多，沿海少，夏季台风活动频繁，既带来降雨，也往往带来洪涝灾害与风暴潮。