境内山地土壤有机质平均含量2.42％±0.54％，属中等水平。但变幅较大，分布极不均匀，分布趋势随海拔高度的增加而增加，即按下列顺序有机质含量逐渐减少：黄壤大于红壤，红壤大于砖红壤性红壤。
　　滨海盐土有机质含量变异也较大，一般海泥土大于海沙土。滨海风沙土有机质含量极为贫乏，固定风沙土有机质平均含量仅0.253％±0.04％。
　　耕作土壤耕作层有机质平均含量为2.2％±0.43％，其中水稻土平均为2.46％±0.30％，其他平均为1.5％±0.50％。市内耕作土壤有机质含量属中等水平。
　　

　　
　　漳州自然土壤全氮平均含量为0.121％±0.02％，水平偏低，含量分布状况是：黄壤含量最大，其次顺序为砖红壤性红壤、盐土、风沙土。缺氮面积占自然土壤面积的59.5％。耕作土壤耕层全氮平均含量0.12％±0.032％，其中水稻土平均含量0.134％±0.01％，属中等水平，其他平均含量0.081％±0.022％，属低量水平。
　　

　　
　　境内土壤磷素由于淋溶强烈，含磷量较低。山地自然土壤全磷平均含量0.06％±0.03％，除黄壤及水化红壤外，其他土壤含量均低于0.01％。速效磷平均含量2.41PPM±0.96PPM，除黄壤、滨海风沙土及滨海盐土含量较高外，其他平均含量小于3PPM。
　　耕作土壤全磷平均含量0.09％，变化幅度极大(0.02％至0.36％)，其中水稻土全磷平均含量0.090％±0.02％，其他土类磷平均含量0.089％±0.067％。速效磷平均含量7.8PPM±2.5PPM，其中水田平均为8.0PPM±2.14PPM，其他平均为7.31PPM±2.86PPM，属低等水平。全市耕地土壤严重缺磷面积103.6万亩，一般缺磷面积64万亩，共占耕地总数的60％。
　　

　　
　　漳州山地自然土壤全钾平均含量1.92％±0.55％，速效钾平均含量102PPM±18.6PPM。全钾及速效钾含量均属中等水平，但缓效钾含量不高，平均为189.9PPM，供钾潜力极低。
　　耕作土壤全钾平均含量为2.45％±0.11％，其中水稻土2.6％±0.57％，其他土类2.29％±0.83％；速效钾平均含量90.5PPM±6.42PPM，其中水稻土96PPM±29.5PPM，其他土类80.1PPM±31.3PPM。全市耕作土壤严重缺钾(速效钾小于50PPM)的有115.4万亩，占耕地41％，一般缺钾(50PPM至90PPM)的有49.6万亩，占耕地18％。
　　

　　
　　境内土壤成土过程具有明显的强淋溶和富铁铝特点，不缺铁锰，但缺锌铜，其面积分别占耕地面积的36.36％、28％。硼被强烈淋失，土壤有效硼含量极低，平均含量为0.075PPM，仅达营养临界值的15％，属严重缺硼区。土壤缺钼亦较明显，耕作土壤有42.15％的面积有效钼含量低于营养临界值。
　　

　　
　　境内自然土壤和耕作层除滨海盐土和埭土外，均呈明显的酸性。耕作土壤耕层质地以中壤和轻壤为主，中壤面积107万亩，占耕地面积39.19％；轻壤72万亩，占26.37％；砂壤53万亩，占19.41％；砂土14万亩，占5.13％；重壤24万亩，占8.79％；粘土3万亩，占1.10％。总之，山区土壤质地较粘，沿海土壤质偏轻。
　　境内土壤粘土矿物均以高岭土为主，永久负电荷低，土壤阳离子代换量低，全市山地土壤阳离子代换量仅6.61毫克当量／100克土±1.72毫克当量／100克土。因此，土壤保肥性能低，缓冲能力差。