(一)鱼　类
　　软骨鱼纲鱼类　有16科22种：虎鲨科　狭纹虎鲨。姥鲨科　姥鲨。须鲨科　日本须鲨、条纹斑竹鲨。鲸鲨科　鲸鲨。皱唇鲨科　皱唇鲨。真鲨科　瓦氏斜齿鲨、短鳍直齿鲨、黑印真鲨。双髻鲨科　路氏双髻鲨。扁鲨科　星云扁鲨。尖犁头鳐科　及达尖犁头鳐。犁头鳐科　斑纹犁头鳐。团扇鳐科　林氏团扇鳐。鳐鲼科　斑点鳐鲼、无斑鳐鲼。蝠鲼科　日本蝠鲼。魟科　古氏魟、赤魟。燕魟科　日本燕鲼。鲭科　鸢鲼、蝠状无刺鲼。
　　硬骨鱼纲鱼类　有103科413种：海鲢科　海鲢。大海鲢科　大海鲢。北梭鱼科　北梭鱼。鼠鱚科　鼠鱚。遮目鱼科　遮目鱼。鲱科　圆腹鲱(尖嘴鳁)、尖吻圆鳆鲱(尖嘴)、脂眼鲱(乾)、金色小沙丁鱼(青鳞鱼)、中华小沙丁鱼、青鳞小沙丁鱼、裘氏小沙丁鱼、孔鳞小沙丁鱼(青鳞)、短体小沙丁鱼、穗鳞小沙丁鱼、鲥鱼、云鰶、斑鰶(姑罗)、圆吻海鰶、印度鳓、鳓鱼、后鳍鱼(弓鞋)。鳀科　日本鳀(乌鲛)、康氏小公鱼(江鱼)、中华小公鱼(江鱼)、印度小公鱼、赤鼻棱鳀(含梳)黄吻棱鳀、杜氏棱鳀颌棱鳀(颌梳)、黄鲫(薄鲫)、七丝鲚(刺鱼、白刺)、凤鲚(黄鲚、红鲚)。宝刀鱼科　宝刀鱼(西刀)。香鱼科　香鱼(溪温)。银鱼科　白肌银鱼(赤尾银鱼)、陈氏新银鱼(银织仔)、尖头银鱼(鸟尾银鱼)、大银鱼。狗母子鱼科　叉斑狗母鱼(狗母)、肩斑狗母鱼(狗母)、大头狗母鱼(番狗母)、长条蛇鲻(狗母)、花斑蛇鲻(乌狗母)、多齿蛇鲻(粗鳞狗母)、长蛇鲻(细鳞狗母)、龙头鱼。鳗鲡科　日本鳗鲡(鳗鱼)、中华鳗鲡、乌耳鳗鲡(乌耳鳗)、花鳗鲡(鲈鳗)。康吉鳗科　尖尾鳗。海鳗科　海鳗(鳗鱼)。蛇鳗科　中华须鳗(蛏鳗)、杂食豆齿鳗、食蟹豆齿鳗(土龙)、尖吻蛇鳗(硬骨鳝)。海鳝科　长体鳝、纲纹裸胸鳝(虎鳗)、黑点裸胸鳝。鲤科　鳡鱼(虎鱼)异鱲、宽鳍鱲、赤眼鳟(红目代)、南方马口鱼、青鱼(溜仔)、草鱼、细鳞斜颌鲴(幼鳞鱼)、银鲴(乌勒仔)、圆吻鲴(赤尾勒)、鳙鱼(红鲢)、鲢鱼(白鲢)、中华鰟鮍、须鱊、斑条刺鰟鮍、兴凯刺鰟鮍、鳌(苦梭料仔)、红鳍鲌、银飘鱼、寡鳞飘鱼、南方拟鳌(浮段)、团头鲂、戴氏红鲌、线细鳊、唇(高锥)、花、麦穗鱼、黑鳍鳈、福建花鳈(石斑)、银颌须鮈、似鮈(高丁)、棒花鱼、黑脊倒刺鲃(粗鳞)、条纹二须鲃、温州厚唇鱼、小口白甲鱼、纹唇鱼、半刺光唇鱼、台湾铲颌鱼、东方墨头鱼(嗅鼻仔)、鲤鱼(鮘鱼)、鲫鱼(鲫仔)、银鲫、日本大阪鲫、刺鲃、拟尖头红鲐。平鳍鳅科　缨口鳅、拟腥吸鳅。鳅科　泥鳅、中华沙鳅、长吻花鳅。鲶科　鲶鱼。胡子鲶科　胡子鲶(塘虱)、蟾胡子鲶。海鲶科　中华海鲶(诚鱼)、海鲶(赤鱼)。鮠科　黄颡鱼、光泽颡鱼、长吻鮠鱼、粗唇鮠鱼、白边鮠鱼、斑点蠖鱼。鳗鲶科　鳗鲶(沙鳗)。鳉鱼科　(青鳉鱼目娘)。银汉鱼科　银汉鱼。颌针鱼科　少嘴扁颌针鱼、横带扁颌针鱼、黑背圆颌针鱼、圆颌针鱼。科　乔氏吻鱼、少耙下鱼、间下鱼、缘下鱼、简牙下鱼。飞鱼科　拟飞鱼、飞鱼、少鳞燕鳐鱼。鳂科　红鳂。海鲂科　日本海鲂。烟管鱼科　毛烟管鱼(火管梭)、鳞烟管鱼(火管梭)。海龙鱼科　尖海龙鱼(海龙)、低海龙鱼、斑海马鱼(海马)、大海马鱼(海马)、日本海马鱼(海咀)。魣科　斑条魣。鲻科　鲻鱼(乌仔鱼)、前鳞(加剥)、梭鲮、鲮鱼(红目鲢)、灰鳍鲮、粗鳞鲮、梭鲻、英氏鲻、赤眼梭鲻。马鲅科　四指马鲅(马鲛)。合鳃科　黄鳝(田鳝)。锯鱼科　眶棘双边鱼。鮨科　侧牙鲈、横带九棘鲈、指印石斑鱼、云纹石斑鱼、青石斑鱼、镶点石斑鱼、点带石斑鱼、大带石斑鱼、花鲈。叶鲷科　叶鲷。大眼鲷科　长尾大眼鲷。　天竺鲷科　黑边天竺鱼、双带天竺鲷、四线天竺鲷。鱚科　多鳞鱚、少鳞鱚。军曹鱼科　军曹鱼。鲹科　短吻丝鲹、沟鲹、马拉巴裸胸鲹、青鳍裸胸鲹、白舌尾甲鲹、六带鲹、珍鲹、丽叶鲹、蓝圆鲹(巴浪)、合圆鲹(竹叶巴浪)、大甲鲹(硬尾铅)、竹夹鱼(大目鲭)、卵形鲳鲹、黑纹条鲹、红海鰆鲹、台湾鰆鲹。眼镜鱼科　眼镜鱼(皮鞋马)。乌鲳科　乌鲳。鯕鳅科　鯕鳅。石首鱼科　叫姑鱼(加纲)、黄唇鱼(金钱鮸)、勒氏短须石首鱼、黄姑鱼(黄婆、春只)、浅色黄姑鱼、白姑、黑姑鱼、鮸鱼(鳘鱼)、大黄鱼(红瓜、黄瓜、黄花鱼)、小黄鱼(小黄瓜)、棘头梅童鱼。鳁科　静鳁(榕叶仔)、鹿斑鳁(金钱仔)、短吻鳁、条鳁(叶仔鱼)、黄斑鳁、粗纹鳁(铜窝微肋)、细纹鳁。银鲈科　短棘银鲈、日本十刺银鲈。笛鲷科　约氏笛鲷(厚唇鱼)、紫红笛鲷、勒氏笛鲷、画眉笛鲷(赤笔)、五带笛鲷(在尾赤鼻仔)、红鳍笛鲷(红曹)、千年笛鲷(打铁婆)。裸颊鲷科　红鳍裸颊鲷、四带裸颊鲷、星斑裸颊鲷(猪哥佬)。鲷科　真鲷(过腊、加拉鱼)、二长棘鲷(板鱼、盘鱼)、四长棘鲷、平鲷(香头)、黑鲷、灰鳍鲷(乌翅)、黄鳍鲷(黄翅)。金线鱼科　波鳍金线鱼、金线鱼、深水金线鱼。锥齿鲷科　灰裸顶鲷。石鲈科　斜带髭鲷(乌过、黑鳃嫂)、横带髭鲷、花尾胡椒鲷(加吉)、中华胡椒鲷(加吉)、石鲈、条纹眶棘鲈。鯻科　叉牙鯻(斑梧、屎龟)、尖吻鯻斑梧(屎龟)、鯻鱼(花斑梧、屎龟)、细鳞鯻(斑梧)、列牙鯻(三抓)。羊鱼科　条尾绯鲤、黑斑绯鲤、黄带绯鲤。白鲳科　燕鱼、万隆燕鱼。鸡笼鲳科　斑点鸡笼鲳。金线鱼科　金线鱼。蝴蝶鱼科　密点蝴蝶鱼、美蝴蝶鱼、珠蝴蝶鱼。丽鲷科　非鲫鱼(罗非鱼)。雀鲷科　乔氏合雅鱼。鮣科　鮣、短鮣。隆头鱼科　蓝猪齿鱼(鹦哥鲤)、菩提鱼、横带厚唇鱼、花鳍海猪鱼、三叶唇鱼、侧斑唇鱼。鹦嘴鱼科　长头鹦嘴鱼、青点鹦嘴鱼、纲条鹦嘴鱼。鲻形鱼科　圆拟鲈。科　日本、少鳞、鱼、青。鳄齿科　鳄齿。科　丝鳍、绯。塘鳢鱼科　乌塘鳢鱼(涂鱼)、尖头塘鳢鱼、沙塘鳢鱼、锯塘鳢鱼。虾虎鱼科　暗缟虾虎鱼、纹缟虾虎鱼、髭虾虎鱼、黏皮鲻虾虎鱼、斑纹舌虾虎鱼、凯氏细棘虾虎鱼、子陵栉虾虎鱼、矛尾復虾虎鱼、斑尾復虾虎鱼、拟矛尾虾虎鱼、矛尾虾虎鱼、六丝矛尾虾虎鱼、蜥形副平牙虾虎鱼、中华纯牙虾虎鱼。弹涂鱼科　强涂鱼(跳鱼)、大弹涂鱼(花跳鱼)、青弹涂鱼。鳗虾虎鱼科　红牙虾虎鱼(赤九)、须鳗虾虎鱼、鲡形鳗虾虎鱼、孔虾虎鱼(红水官)。刺尾鱼科　短吻鼻鱼。篮子鱼科　黄斑篮子鱼、褐篮子鱼(咬芒)。带鱼科　小带鱼、带鱼(白鱼、白带鱼)、沙带鱼、窄颅带鱼。鲭科　鲐鱼(花鲱)、狭头鲐(花鳀)、羽鳃鲐、康氏马鲛(马鲛)、中华马鲛(马鲛)、蓝点马鲛(马鲛)、斑点马鲛(马鲛)、朝鲜马鲛(马鲛)、青干金枪鱼、扁舵鲤(铅锤)。鲳科　银鲳(白鲳)、灰鲳、中国鲳、刺鲳(肉鱼)。攀鲈科　攀鲈(过山鲫)、叉尾头鱼(三关)、圆尾斗鱼。月鳢科　斑鳢(历鱼)、月鳢(孤朵)。鮋科　褐菖鮋、棘鮋、花腋鳞头鮋、斑鳍鮋(石降)、美丽短鳍蓑鮋、锯棱短蓑鮋、勒氏蓑鮋、环纹蓑鮋、印度赤鮋、蜂鮋。毒鮋科　虎鮋、丝鳍虎鮋、鬼鮋(虎鱼)、头鮋。鲂鮄科　绿鳍鱼、短鳍红娘鱼、贡氏红娘鱼、翼红娘鱼、日本红娘鱼、鳞胸红娘鱼。红鲬科　红鲬。鲬科　日本瞳鲬、鳄鲬、鲬、蓝氏棘鲬。鰜科　大口鰜(小齿)。鲆科　花鲆、牙鲆(酒平)、斑鲜(土铁子)。鲽科　大叶鲽、冠鲽。鳎科　箬鳎(猫舌)、条鳎。舌鳎科　日本须鳎、宽体舌鳎、大鳞舌鳎、斑头舌鳎、焦氏舌鳎、半滑舌鳎、三张舌鳎(淡水贴沙)、短吻舌鳎、窄体舌鳎。三刺鲀科　三刺鲀(刺迪)、尖吻假三刺鲀、宽愤鳞鲀。革鲀科　中华单角鲀、绿鳍马面鲀(剥皮鱼)、绒纹单角鲀。箱鲀科　双蜂三棱箱鲀、突吻尖鼻箱鲀、角箱鲀。鲀科　光免鲀、杂斑腹刺鲀、棕腹刺鲀(乌乖)、横纺东方鲀、条纹东方鲀(红目乖)、铅点东方鲀、星点东方鲀、弓斑东方鲀、暗纹东方鲀、双斑东方鲀、头纹宽吻鲀、凹鼻鲀。刺鲀科　六斑刺鲀。翻车鲀科　翻车鲀。鮟科　黑鮟(拉屎乖)。躄鱼科　钱斑躄鱼、三齿躄鱼、黑躄鱼。蝙蝠鱼科　棘茄鱼、烟纹棘纹鱼、中华棘茄鱼。鲡条科　莫桑比克罗非鱼、尼罗罗非鱼。
　　(二)虾　类
　　日本对虾、长毛对虾、宽沟对虾、斑节对虾、中国对虾、龙虾、龙虾(虾魁)、长眼对虾、周氏新对虾、刀额新对虾(沙虾)、中型新对虾、哈氏仿对虾、戴氏赤虾、须赤虾、中华管鞭虾、日本毛虾、中国毛虾、刺鳌鼓虾、锯齿长臂虾、敖氏长臂虾、脊尾白虾。
　　(三)蟹　类
　　锯缘青蟹、远洋梭子蟹(蠘)、三疣梭子蟹、三星梭子蟹、厦门银杏蟹、强壮紧握蟹、艾氏寄居蟹、日本寄居蟹、日本关公蟹、逍遥馒头蟹、长螯拳蟹、豆形拳蟹、硅形蟹、日本蟹(蟳)、斑纹蟹、绒毛银杏蟹、中华豆蟹、长腕和尚蟹、锯缘泥蟹、中华绒毛蟹、平掌砂蟹。
　　(四)贝　类
　　蝾螺、中国笔螺、笔螺、泥螺(吐铁)、麦螺、中华海兔、黑指纹海兔、泥蚶、杂色鲍、笠贝、翡翠贻贝、厚彀贻贝、栉江珧(江瑶)、褶牡蛎、近江牡蛎、棘刺牡蛎、僧帽牡蛎、日本镜蛤、海月蛤(窗贝)、河蚬、文蛤、青蛤、杂色蛤(旧志记载的“西施蛤”、“蛤蜊”，均蛤之属)、中国绿螂、缢蛏、短竹蛏、石蛏、海笋、泥笋、真蛸、长蛸、短蛸、、金乌鲗。
　　(五)头足类
　　鱿鱼(棆乌贼)、章鱼、墨鱼(乌贼)、锁管、猴染。
　　(六)棘皮类
　　五角海星、真五角海星、紫海胆、马粪海胆。
　　(七)腔肠类
　　黑藤壶、沙海葵、管海葵、海蜇(海、水母)。
　　(八)星虫类
　　星虫(沙肠子)、土钉。
　　此外在平和灵通山涧发现有娃娃鱼(鲵)，但未见到成鱼。