漳州地处华南褶皱系东部，中生代以前为隆起区。自中生代燕山运动以来，发生强烈的断裂活动和岩浆活动，至燕山晚期，已基本形成现今的构造轮廓；尔后又经历多次强烈活动，至今仍在继续活动。
　　境内出露的地层较全，多期次侵入岩、火山岩、变质岩广泛发育，构造复杂，但其分布具有明显的方向性——北东向条带分布，由西向东，地层分布、火山岩带、侵入岩带和变质岩带由老逐渐到新，明显受构造控制，形成重要的地质特征。
　　境内断裂、褶皱构造主要方向为北北东、北东、东西、南北及北西向，还有其它构造形式，如船山场山字型构造、东泗帚状构造等。
　　(一)北东向构造
　　1.政和—大埔断裂带
　　主干断裂位于漳州与龙岩之间，在漳州出露的有：
　　和溪—梅林断裂带　位于本区西部，由月明－和溪断裂和上科岭断裂组成。走向北东20度至30度，倾角陡立，断面呈舒缓波状，断裂带普遍发育有片理、构造透境体、麋棱岩化、硅化、叶蜡石化、绿泥石化等蚀变现象。
　　赤洲—桂竹洋断裂带　北起南靖赤洲，向南南西延伸至平和桂竹洋一带。出露45公里以上，宽3公里至10公里不等，倾向北西，倾角50度至70度。断裂面较平直，呈舒缓波状，具擦痕与阶步，铁质薄膜。北西盘向南西相对扭动。岩石破碎，构造角砾岩发育。具硅化、叶蜡石化、黄铁矿化、绿泥石化。北北东向分布的火山喷发中心自北而南有白叶林尾山—桂竹洋喷发中心、岭脚喷发中心及桂竹洋喷发中心。
　　华安—九峰褶断带　位于和溪－梅林断裂带之东，北部分为两支：一支自华安福锅尖向西南经华安至南靖，呈北东20度至30度走向断裂，倾角不稳定。沿断裂带普遍有片理化、麋棱岩化、构造透境体及擦镜面等断裂活动标志；另一条自长泰龙德经坂里、汰内至靖城，由北东40度至50度的断裂和褶皱组成。断面呈舒缓波状，挤压强烈，普遍具片理化现象。伴生有北西向断裂和南北向、东西向断裂。南部自靖城向南西经平和土田、豆坪、九峰延伸入广东境内，由一系列北东40度左右的褶皱、断裂和片理化带组成。
　　靖城—大溪褶断带　自靖城、五峰山附近向南南西经平和文峰、坂仔、南寮山至大溪，全长近100公里，宽3公里至10公里。由一系列右列式雁行排列的断裂组成，总体构成一个多字型构造。北段由靖城—五峰山、石盘山、蜈蚣山、大坑山断裂组成；中段由文峰—风门、云后—顶城断裂组成；南段由灵通山—大溪、岩下、大溪断裂组成。
　　2.长乐—诏安断裂带
　　自灌口向南西斜贯全区，宽约20公里，区内出露长约160公里。断裂走向北东40度至50度，由西向东可分为4个褶皱、断裂带。
　　角美—大布褶断带　位于漳州中部，呈北东向斜贯全区，将漳州划分为西部以褶皱、断裂、古火山活动为特征，东南部以断裂、岩浆活动、动力变质为特征的两个构造区。该断裂北起角美、灌口一带，向东南经象牙至诏安大布，全长140公里，宽5公里至20公里。主要由紧密复式背斜与断裂带组成。构造方向为北东45度左右。主要褶皱有白云山—大茂山—和平农场—大潭水库复式大背斜，断续出露110公里。断裂以角美—大布断裂为主干断裂，自角美到大布，由1条至4条断续分布的断裂组成，断裂倾角甚陡，为70度至80度，倾向以北西为主，呈舒缓波状延伸。断裂切过上侏罗统南园组火山岩及燕山期花岗岩，岩石受强烈挤压，片理化、硅化发育，挤压带宽度常超过百米。
　　佛昙—南澳褶断带　位于漳州东南部，大致沿海岸线展布。北起佛昙，经杜浔、常山至南澳岛伸入海中，出露150公里以上，宽度5公里至15公里。褶断带由一系列北东向断续分布的断裂为主，伴有频繁的岩浆活动。
　　东山晚近期北东向动力变质带　北起杜浔，南至南澳，沿海岸及近岸岛屿分布着一套复杂的动力变质岩带，全长近90公里。变质带普遍发育着片理、片麻理，褶皱轴向、断裂走向与变质带方向一致。褶皱有双岭—埔头向斜、亲营山向斜；断裂有东山—前梧断裂，亲营山北东向帚状裂隙，其旋转轴近直立。
　　滨海断裂带　位于40米至50米等深线附近。在卫星照片上十分醒目。出露在一些近岸岛屿如兄弟屿，岛上发育走向北东50度至55度的断裂，倾向北西，还可见陡峭的断层崖。
　　(二)东西向构造
　　大致于北纬24°06′至24°40′之间，断续地展布着一条横贯东西复杂构造带，南北宽约60公里，东西长达100公里以上。
　　东西向构造带发育时间较早，延续较长，直至近代尚很活跃，具有多期性、复杂性、差异性等特征。由于后期构造活动及其构造的作用，因此东西向构造带支离破碎。由北而南有3条主要的构造带。
　　1.福田—华安断裂带
　　位于北纬24°50′至25°10′之间，由草坂东西向斜、目击坑冲断层、和春断裂带、西顶花岗岩中的断裂和宽百米的挤压、片理化带及坂里丹岩挤压带组成。
　　2.厦门—南靖断裂带
　　位于北纬24°20′至24°40′之间，由厦门、灌口经漳州至南靖书洋，西段与船山场山字型构造合并，全长110公里，宽5公里至20公里。由东西向浅变质带、断裂、褶皱和侵入体组成。沿断裂带出露诸多温泉，其中著名的有汤坑、漳州、东孚温泉。历史上发生过破坏性地震，现在仍是弱震密集区。存在重力场和航磁异常带。
　　褶皱有角美隐伏向斜、平和后畲背斜。浅变质带有厦门文圃山—汤坑东西向片理化带，中段漳州圆山南麓下侏罗统梨山组中亦发现片理化砂岩，蚀变强烈，具绿帘石化、绿泥石化以及硅化等现象。断裂可见：小岭—长泰断裂，延长约23公里，为一挤压破碎带，具强烈硅化、片理化，局部见擦痕，断裂走向东西，向北倾，倾角80度以上；圆山—汤坑—土田东西向断裂，长35公里，宽5公里。由1条至5条断裂组成，圆山可见长3公里、宽百米的东西向挤压破碎带。汤坑断裂十分密集，出现一系列高角度冲断层，挤压剧烈，构造角砾岩发育，硅化强烈。
　　沿东西向主干断裂伴生有南北、北西向断裂。在中段，伴生有漳州南北向断裂，长8公里，主要为硅化破碎带，最宽处达百米以上，其中有大量的岩脉充填于内。西段有汤坑南北向断裂，长约3公里，断裂中岩石极破碎，见大量的断层角砾岩。伴生北西向断裂有珠坑—漳州断裂，位于漳州西北部，长7公里；古湖—圆山断裂，位于漳州西，长约6公里；军脚洋—山边断裂，位于土田东3公里，长7公里。
　　据卫星相片，金门岛、小金门岛、厦门岛、鼓浪屿等岛屿的南界为一东西向断裂所切；九龙江西溪北岸为一平直的东西向河岸，可见该断裂规模较大。
　　3.湖西—象牙断裂带
　　位于北纬24°06′至24°20′之间，由一系列东西向密集的断裂、变质带组成。断裂东起湖西、佛昙，向西延伸至桥内、象牙一带逐渐消失，长达50公里，宽5公里至10公里。主要断裂为湖西—桥内断裂，漳浦—象牙断裂。
　　(三)南北向构造
　　位于东经116°55′至118°20′之间，由走向南北的断裂、褶皱、变质带、侵入体组成，地貌上显示清楚。
　　1.曲江—芦溪断裂带
　　保存完整，规模较大。南起广东梅县双记山，向北至芦溪、曲江，再向北进入龙岩，切割上侏罗统南园组火山岩和花岗闪长岩、花岗岩。全长60公里以上，最宽处近百米。主要为近南北向呈舒缓波状、高角度冲断层。在地貌上常呈“V”型断裂谷，两侧断层三角面发育。
　　2.华安—靖城断裂带
　　位于东经117°25′至117°35′之间，自华安草坂向南延伸至新圩、金山，随后又在靖城—文峰一带出现，由南北冲断层和褶皱组成。
　　(四)北西向构造
　　北西向断裂亦是规模较大的构造之一。它切过出露的所有地层、岩体和其它方向的断裂、褶皱，是境内形成最晚的构造。在地貌上控制部分山脉、水系、海湾，控制温泉出露与地震带的分布，是至今仍在活动的断裂构造带。
　　1.九龙江下游两岸断裂带
　　位于境内北西向断裂最发育的地段，主要断裂有：北岸，天成山—狮岩山、江东桥、郭坑、石盘陀等断裂；南岸，珠坑、穴口村、水头、洪塘和东泗等断裂。断裂走向北西300度至320度之间，倾角南西或北东，倾角大于45度，产状稳定。断层角砾岩发育，见石英脉侵入和后期铁、锰质充填。从卫星像片上可见漳州—龙海平原中有一条深灰色线状西向隐状断裂，东南端延伸入海。
　　2.九峰—古雷头断裂带
　　由一系列走向北西300度至320度，倾向南西的断裂组成，破碎带宽达百米。
　　3.官陂—诏安断裂带
　　由两条平行的断裂组成，从官陂—红岭头—鹧鸪洞至西潭，向东入海。
　　(五)扭动构造
　　1.东泗帚状构造
　　分布于龙海石码镇至赤岭间的火山熔岩和花岗岩中。旋回面由十多条弧形、雁行排列的断裂破碎带组成，全长32公里，宽2公里至8公里，涉及面积约100平方公里。
　　2.安厚帚状构造
　　位于平和与云霄之间，全长40公里，宽3公里至25公里，涉及面积600平方公里。其外侧为燕山早期花岗岩体，内侧为下白垩统石帽山群火山岩。此外还有高安帚状构造。
　　3.船场山字型构造
　　位于南靖县西北部，南北宽约25公里，东西长约60公里，规模不大，形态完整。前弧朝南，弧顶平缓，两翼对称，卷入的岩层有古生界、中生界沉积岩和大片上侏罗统南园组火山岩，呈弧形展布，脊柱发育于弧顶内侧的燕山早期花岗岩中。
　　

　　漳州东南濒临台湾海峡，临海正面宽度达128公里，海岸线曲折，由一系列自大陆向西南延伸的斜列式半岛与海湾组成。外海域海底平坦，50米等深线距岸远达30公里至70公里，是块准海底平原，海底深槽线偏离海峡中心线，逼近台湾西海岸。
　　近陆海底岩石是大陆岩块延伸部分，稍外有一条与斜列式半岛顶端联线接近平行的滨海断裂带。这条断裂带在卫星照片上十分醒目，出露在一些近岸岛屿如兄弟屿上，走向北东50度至55度，倾向北西，在岛上可见到陡峭的断层崖。在台湾海峡北侧，靠近台湾西海岸海底，亦存在一海底断裂带，并往南与吕宋弧相接。两断裂带之间海底地块，地质上称南海亚板块，板块中间宽，两头窄，契入海峡部分是板块北端窄尖部分。吕宋弧以东为菲律宾板块。
　　海峡地壳变迁受欧亚板块、南海亚板块与菲律宾板块相对运动影响。当菲律宾板块向北西西向俯冲挤压时，导致海峡弧后扩张(沿海峡纵向)，海峡陷落为海。当亚板块北推时，导致海峡受纵向挤压，产生近东西向隆起，上升为陆。两者周期性反复交替作用，导致海峡上升为陆与陷落为海交替出现。这种现象从第四纪以来数次发生，最后陷落为海始于约距今1.2万年前的晚更新世。海峡中十多个沉积物碳14(C¹⁴)测定年龄大多在1万年左右，由此推断目前台湾海峡的形成，大致是在距今1万年左右的时期。
　　当南海亚板块向北推进时，在海峡中可引起近东西向褶皱，海底地形测量证实，在海区南北各有一近东西向隆起，南部为台湾浅滩(隆起)，位置在汕头至台南连线稍南处，北部为澎北隆起，位置在漳州至台中连线上。根据有的文献研究，这两隆起目前还以一定速率上升，有可能分别在6000年、8000年后露出水面，成为大陆与台湾间的陆桥部分。两隆起之间为一凹陷构造，称为厦澎凹陷，面积5000多平方公里，沉积厚度最厚处达8000多米，具有较好的生储油条件。